Масс-спектрометр с ионной подвижностью timsTOF

Ключевые особенности

• Система для экспресс-идентификации микроорганизмов, идентификация микроорганизмов и дифференциация штаммов широкого спектра возбудителей, низкая себестоимость анализа.

ОПИСАНИЕ

Новейший квадруполь-времяпролетный масс-спектрометр высокого разрешения с разделением по ионной подвижности timsTOF.

Особенностью прибора является уникальный механизм разделения по ионной подвижности: спектрометрия ионной подвижности с улавливанием частиц электрическим полем (англ. Trapped Ion Mobility Spectrmetry или TIMS). В случае TIMS ионы продвигаются через туннель TIMS потоком газа. При этом электрическое поле удерживает каждый ион в той точке, в которой движущая ион сила, обусловленная столкновениями с молекулами газа, уравновешена силой электрического поля. Снижение напряженности электрического поля позволяет селективно инжектировать ионы из туннеля TIMS в соответствии с их ионной подвижностью. Принцип улавливания и селективного высвобождения ионов позволяет добиться непревзойденного разрешения при разделении по ионной подвижности (до 200), а также дает возможност параллельного накопления ионов для почти 100% эффективного рабочего цикла.

Разделение по ионной подвижности позволяет добавить наряду с хроматографией и масс-спектрометрией еще одно измерение, в котором происходит разделение. Сочетание высокого разрешения по ионной подвижности с высоким разрешением (более 50 000) времяпролетного масс-анализатора позволяет добиться качественного роста селективности и надежности анализа, а также подходить к таким задачам, как идентификация изомерных и изобарных соединений при совместном присутствии.

timsTOF совмещает в себе разделение по ионной подвижности высокого разрешения, превосходные характеристики квадруполь-времяпролетного масс-спектрометра и уникальный набор возможностей, позволяющий максимально гибко подходить к решению Ваших задач.

timsTOF Pro

Использует технологию сбора данных Parallel Accumulation Serial Fragmentation (PASEF) чтобы обеспечить чрезвычайно высокую скорость и чувствительность для достижения новых глубин в shotgun-протеомике и фосфопротеомике, используя малые количества образцов.
Открытый формат данных позволяет работать с сырыми данными и использовать ведущее в отрасли программное обеспечение. MaxQuant был адаптирован для управления 4-мерными (4D) функциями в пространстве, охватываемом временем удержания, подвижностью ионов, массой и интенсивностью сигнала, которые способствуют идентификации и количественной оценке пептидов, белков и посттрансляционных модификаций. PEAKS Studio сочетает в себе секвенирование de novo с традиционными поисками в базе данных и оптимизирован для времени обработки сырых данных.

Компания Bruker представила новые масс-спектрометры: timsTOF SCP для одноклеточной 4D-протеомики и timsTOF Pro 2, оснащённый последовательной фрагментацией с параллельным накоплением (PASEF^®) для 4D-протеомики и 4D-липидомики.

Масс-спектрометрическая протеомика стала основным направлением современных исследований в понимании биологических функций и механизмов заболеваний. Здоровые или больные ткани, которые кажутся однородными, состоят из клеток с множеством различных протеомов. Задача расшифровки протеомов в каждой отдельной клетке — гетерогенность клеток — является ключом к полному пониманию их функций.

Новые аппараты Bruker timsTOF развивают и открывают новые приложения и методы в непредвзятой протеомике, эпипротеомике/ПТМ-характеристике и непредвзятом глубоком открытии мультиомных биомаркеров, например, в исследованиях жидкостной биопсии рака. Сотрудники компании добились значительного прогресса в области объективной одноклеточной протеомики, фосфопротеомики и плазменной протеомики.

timsTOF SCP

Специализированный сверхвысокочувствительный прибор для объективной одноклеточной протеомики, после лазерного захвата микродиссекции одной или нескольких клеток, а также для обнаружения сверхчувствительных неоантигенов в иммунопептидомике в области иммуноонкологических исследований для обнаружения нео-антигена, где доступный материал ограничен, как в биопсиях игл.

timsTOF Pro 2

Данный аппарат предлагает более глубокое покрытие протеома: более чем 6 000 белковых групп и гораздо больше, чем 60 000 уникальных пептидов в 60-минутных градиентах. Он обеспечивает чрезвычайно высокую скорость работы с повышенной чувствительностью анализа, требуя при этом минимальное количество образцов.

С появлением нового поколения timsTOF компания Bruker продолжает революцию в 4D-протеомике с поддержкой CCS, а также в 4D-эпипротеомике, определяемой в широком смысле — как характеристика всех посттрансляционных модификаций белка (PTMs).

Компания Bruker также анонсировала новые возможности в программном обеспечении PaSER поиска в реальном времени для 4D-протеомики. Новый PaSER 2022 предлагает крупномасштабную биоинформатику с поддержкой CCS, использующую уникальные методы tims/PASEF. Например, новый TIMScore™ повышает достоверность идентификации пептидов, используя четвертое измерение крупномасштабных поперечных сечений столкновений (CCS) для всех измеренных пептидов.

Повышенная уверенность при использовании CCS уменьшает двусмысленность избыточных пептидных последовательностей, что приводит к большему количеству белковых групп и уникальным идентификациям пептидов, основанным на том контроле FDR.

Преимущества нового оборудования

• Сверхвысокая чувствительность и устойчивость;

• Обработка данных MaxQuant/Perseus и PEAKS Studio: независимое получение результатов и высокая скорость сбора данных;

• Длительная работа без проведения очистки;

• Радикально улучшенный перенос ионов;

• Резкое улучшение производительности протеомики;

• Dual-TIMS, анализ с поддержкой CCS;

• PaSER Run & Done — контроль качества в реальном времени для непредвзятого анализа одной ячейки.