Определение точного значения массы иона с помощью матрично-активированной лазерной десорбции/ионизации

Описание лабораторного теста: Определение точного значения массы иона с помощью матрично-активированной лазерной десорбции/ионизации

Используемое лабораторное оборудование:

Времяпролетный тандемный масс-спектрометр высокого разрешения с матрично-ассоциированной лазерной десорбцией-ионизацией (MALDI)

Прибор  собран на основе тандемной масс-спектрометрической системы высокого разрешения с матрично-ассоциированной лазерной десорбцией-ионизацией и функцией высокоэнергетической соударительной диссоциации ионов (MALDI) iDplusPerformance на базе масс-спектрометра AximaPerformance. Производитель — Shimadzu Group Company, Kratos Analytical Ltd, UK.

Прибор позволяет выполнять изучение молекулярного состава химических веществ различной природы, контролировать качество и расшифровывать состав полимеров и белков, картировать гистологические препараты, идентифицировать микроорганизмы.

 Технические характеристики оборудования

• Диапазон масс от 1 до 500 000 Да (в линейном режиме), от 1 до 80 000 Да (в режиме рефлектрона).
• Разрешение по массам, не менее 5000 для 2465 Да (в линейном режиме); не менее 20000 для 3660 Да (в режиме рефлектрона).
• Разрешение в режиме МС/МС: Изотопное (Ангиотензин).
• Точность по массе с внешней калибровкой, не более 200 ppm (в линейном режиме); не более 50 ppm (в режиме рефлектрона).
• Точность по массе с внутренней калибровкой, не более 30 ppm (в линейном режиме); не более 5 ppm (в режиме рефлектрона).
• Точность по массе в режиме МС/МС с внешней калибровкой, не более 150 ppm.
• Разрешение ионного фильтра, не менее 400 для 1000 Да.
• Чувствительность в области высоких масс, не более: 250fmol БСА (в линейном режиме).
• Чувствительность в области высоких масс, не более:250amol Glu-1-fib (в линейном режиме).
• Чувствительность в области низких масс, не более: 250аmole Glu-1-fib (в режиме рефлектрона).
• Чувствительность в режиме МС/МС, не более: 2.5fmol Glu-1-fib.
• Характеристики отделения для образцов:
  • автоматизированная система ввода,
  • двухкоординатный столик (шаг 10 мкм) для держателей образцов формата МТП,
  • быстрая откачка турбомолекулярым (250 л/с) и форвакуумным насосами,
  • программное управление предметным столиком для точного позиционирования образцов в фокусе лазера,
  • растровое сканирование для поиска горячих точек,
  • видеокамера с увеличением х25.
• Характеристики источника ионизации:
  • матрично-опосредованная лазерная десорбция-ионизация,
  • импульсная экстракция (переменная масс-калиброванная задержка) и непрерывная экстракция по выбору оператора,
  • варьируемая энергия экстракции ионов (+25 / -20 kV в линейном режиме, +20 / -20 kV в режиме рефлектрона),
  • программируемое исследование положительно и отрицательно заряженных ионов.
• Характеристики лазера:
  • азотный, 337 нм, фиксированный фокус,
  • длительность импульса 3 нс,
  • номинальная энергия — 100 мкДж на 1 вспышку,
  • максимальная частота вспышек — 50 Гц,
  • около нормальное (осевое) падение лазерного луча на образец,
  • программируемые энергия и местоположение вспышки.
• Характеристики детектора:
  • линейный режим — электронный умножитель,
  • режим рефлектрона — высокоскоростная микроканальная пластина,
  • регистратор быстропротекающих процессов 2 ГГц, 8 бит, накопитель 16 бит,
  • дополнительный регистратор быстропротекающих процессов для одновременной детекции нейтральных частиц 125 МГц, 8 бит, 128 кБ ОЗУ.
• Характеристики анализатора:
  • линейная пролетная трубка длиной 1.2 м,
  • эффективная длина пролета в рефлектроне — 2,0 м,
  • вакуумная система с двумя турбомолекулярными (250 л/с) и форвакуумными насосами,
  • система рефлектрона с искривленным полем и возможностью соударительной диссоциации с энергией 20 keV без повторного ускорения,
  • запирание пучка для подавления нежелательных высокоинтенсивных сигналов, например, ионов матрицы.
  • ионный фильтр для выделения ионов-прекурсоров с близкими массами,
  • дифференциально вакуумируемаясоударительная ячейка (20 keVCIDMS/MS) с автоматическим вводом гелия, высокой эффективностью фрагментации и высочайшей чувствительностью.
• Программное обеспечение — LAUNCHPAD:
  • автоматическая оптимизация получения данных
  • определение теоретических масс
  • определение и операции с последовательностями аминокислот в пептидах (включая теоретические массы фрагментов)
  • автоматическая установка иона прекурсора и получение MS/MS спектра
  • сканирование и идентификация «горячих точек»
  • редактор геометрии держателей образцов
  • редактор установки растра
  • функция LowMassZoom™ для детализации низких масс и фрагментных ионов иммония, облегчающая интерпретацию спектров MS/MS, секвенирование пептидовdenovo и специальные количественные определения
  • средства генерации списков пиков и удаленного доступа в системы идентификации пептидов (MASCOT от MatrixScienceLtd.)
  • KOLA™ для удаленного доступа в системы идентификации пептидов (MASCOT от MatrixScienceLtd.)
• Экспертная система SARAMIS (Spectral ARchive And Microbial Identification System) Premium:
  • система на основе базы масс-спектрограмм интактных микроорганизмов для типирования микроорганизмов на основании их масс-спектров,
  • организация библиотеки в виде СуперСпектров для каждого вида микроорганизмов,
  • сформированный характерный набор белков (биомаркеров), полученных на основе анализа не менее 20 масс-спектров этого вида, образцы получены из различных источников,
  • коллекция первичных масс-спектров микроорганизмов (FingerprintSpectra), состоящая из 50000 образцов, предназначена для научной работы – исследований окружающей среды, экологического мониторинга, стандартизации микробиологических коллекций,
  • обработка, хранение, сортировка масс-спектров микроорганизмов и других биологических объектов,
  • выстраивание таскономических иерархий масс-спектров, формирование консенсусных спектров близкородственных объектов,
  • идентификация микроорганизмов в автоматическом режиме с помощью базы СуперСпектров.